维普资讯 http://www.cqvip.com 一8一 江苏农业科学2006年第4期 水稻TAC基因组文库的筛选与克隆转化 周玲艳 ,姜大刚 ,庄楚雄 (1.仲恺农业技术学院生命科学学院,广东广州510225;2.华南农业大学生命科学学院,广东广州510642) 摘要:利用一个cDNA片段筛选了水稻品种台中65 TAC27基因组文库,获得一个阳性克隆,将该阳性克隆 转化水稻温敏核不育材料7001S并获得转化苗,转化苗经PCR检测,证实外源基因已整合到水稻基因组中。 关键词:水稻;基因组文库;阳性克隆;转化 中图分类号:¥511.035.3 文献标识码:A 文章编号:1002—1302(2006)04—0008—03 基因组文库是进行分子克隆与基因组结构及功 室苏菁构建。筛选基因组文库用的cDNA片段由华 能研究的基础,构建基因组文库并进行筛选是克隆 南农业大学生命科学学院庄楚雄提供。 完整基因的经典方法。植物遗传转化技术不仅是遗 1..1.2 载体和菌株 质粒载体为pYLTAC27 传改良的重要手段,而且是研究基因和基因组功能 (图1)(华南农业大学遗传工程实验室刘耀光提 必不可少的技术,通常从不同途径克隆出的基因都 供),该质粒载体既可用于基因克隆,又可直接用于 须通过转化来验证或进行功能测定。应用于基因组 植物遗传转化,筛选标记基因为her基因。农杆菌 文库构建的载体系统主要有YAC、BAC、PAC、BI- 菌株为LBA4404。 BAC和TAC等。TAC载体系统是在结合PAC载体 1.1.3 PCR扩增引物 基因: 和双元载体优点的基础上建立起来的…,它含有P1 5 一GTCCGTCAGGACATTGTrGGAG一3 质粒和Ri质粒的复制子,能在农杆菌和大肠杆菌穿 5 一GTCTCCGACCTGATGCAGCTCTCGG一3 梭,而且既可用于基因克隆,又可直接用于植物遗传 1.1.4植物培养基培养基参照文献[7]。 转化,省去了亚克隆的步骤。应用TAC载体已构建 了拟南芥…、小麦 J、水稻 等基因组文库,并应用 TAC载体已经成功克隆了多个拟南芥基因-l,4 ]及 花发育相关基因 J。TAC载体系统已包括TAC7、 TAC17、TAC27、TAC747等,以适于不同植物材料和 目的使用。本研究筛选水稻温敏核不育系的恢复系 台中65 TAC27基因组文库,获得的阳性克隆转化水 稻,建立了混合基因组文库的筛选方法以及成功建 立了TAC27的转化系统。 注:P1复制子和m复制子分别使TAC质粒在大肠杆菌 和农杆菌中进行复制;P1复制子可在IPTG诱导下增加质粒拷 贝数而提高质粒产量;sacB是大肠杆菌启动子驱动下的蔗糖 1材料与方法 诱导致死基因。 1.1材料 1.2 方法 1.1.1 基因组文库和筛选文库探针 台中65 1.2.1基因组文库的筛选 TAC27基因组文库由华南农业大学遗传工程实验 1.2.1.1高密度膜的制备用384孔针将TAC27 收稿Et期:2006—03—02 文库384孔板上的混合克隆点印在一张Hybond— 基金项目:国家“863”计划项目(编号:2002AA224121);国家自然科 N 膜上。为了避免假阳性,在进行基因组文库转膜 学基金资助项目(编号:30080019)。 时,每一块384孔板在膜上呈对角方向点两个重复, 作者简介:周玲艳(1972一),女,湖南衡阳人,硕士,讲师,主要从事 实验中采用3×3列阵点膜。将点印好的膜放在含 水稻遗传与生物技术研究。Tel:(020)31517278;E—mail: 25 ml Kan和0.5 mmol/L IPTG的固体LB方板 lingyanzh@163.tom。 上,37℃培养过夜。将膜取出,置于已用5%SDS、 维普资讯 http://www.cqvip.com 周玲艳等:水稻TAC基因组文库的筛选与克隆转化 ・--——9・--—— 0.2 X SSC溶液浸湿的滤纸上处理5 min,使菌体裂 解,用微波炉烘烤3~4 rain至膜完全烘干,使DNA 变性并完全固定于尼龙膜上。再用煮沸的洗液将膜 漂洗干净,并用微波炉烘干高密度膜,保存备用。 1.2.1.2文库筛选分两次杂交筛选,第一次是筛 选台中65 TAC27混合基因组文库。然后根据第一 轮杂交的结果,在文库中取与杂交阳性克隆对应孔 的克隆进行不同倍数的稀释,并涂LB平板(含Kan 将第二次筛选得到的阳性克隆进行培养、抽提 质粒DNA、历柑Ⅲ酶切、电泳,结果表明筛选台中 65 TAC27的l6个阳性克隆为同一克隆(图4)。将 酶切DNA转膜,用筛选基因组文库回收的探针进行 杂交,结果表明克隆均有相同的杂交带(图5),从而 进一步证实了酶切分类结果的正确性。 1234567891011121314151617l819∞212223 25 ̄g/na),经37℃培养15 h后,挑取单克隆于无 菌且加有LB液体培养基的384孔板中,37 o【=培养8 h左右,进行杂交膜的制备。制备的杂交膜用第一 次杂交回收的探针进行第二轮筛选。 1.2.1.3 阳性克隆的分类、鉴定将第二次筛选得 到的阳性克隆进行培养、抽提质粒DNA,用HindliT 酶切,并进行Southenr Blot鉴定。 1.2.2阳性克隆转化水稻 1.2.2.1愈伤组织的浸染及共培养挑选颜色新 鲜、淡黄色、致密、生长旺盛的颗粒状胚性愈伤组织, 将愈伤组织和农杆菌菌液按一定的比例混合,浸染 20 min,期间摇动几次。取出愈伤组织,并用灭菌的 滤纸吸去多余的菌液。将愈伤组织接到加有一张滤 纸的共培养培养基上,26℃下暗培养2~3 d。 1.2.2.2抗性愈伤组织的筛选、预分化及分化将 共培养后的愈伤组织取出放在有3层滤纸的灭菌培 养皿中干燥2~3 d,经干燥处理过的愈伤组织接人 含合适筛选压的筛选培养基上,筛选2次,每次2~ 3周。挑选生长状态好的抗性愈伤组织接人预分化 培养基上,26 o【=,光照培养3周,再将新的抗性愈伤 组织接人分化培养基上分化成苗。 1.2.2.3 转化苗的PCR检测 抽提转化植株 DNA,进行Hyg基因的PCR扩增。 ●2结果 ’‘ , 2.1 基因组文库的筛选与鉴定 2.1.1 基因组文库的筛选 以eDNA片段P47为 探针,筛选粳稻品种台中65 TAC27基因组混合文库 获得一个阳性克隆,编号为07N14(图2)。将第一 次筛选得到的阳性克隆取少量菌液进行一定倍数的 稀释,分别涂3~4个LB平板(含Kan 25 txg/m1), 然后挑单菌落于384孔板中,共挑2块384孔板,按 前面的点膜方式进行转膜,以第一次筛库的标记探 针进行第二次杂交。结果共获得16个阳性克隆 (图3)。 图2 第一次筛选TAC27文库的结果 1234567891011121314151617l819∞212223 图3 第二次筛选TAC27文库的结果 图4 阳性克隆日i Ⅲ酶切结果 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 n ・・-・..; --0 _1簪 一『 奢 ■ 图5阳性克隆HindⅢ酶切后杂交结果 维普资讯 http://www.cqvip.com 一l0一 江苏农业科学2006年第4期 2。2 阳性克隆转化水稻 2.2.1 抗性愈伤组织及再生植株的获得共培养 2000bp 1 000bp 750bp 500bp 250bp 100bp 后愈伤组织干燥处理2—3 d,然后接入筛选培养基, 非转化的愈伤组织10 d左右基本上褐化死亡,抗性 愈伤组织能迅速增殖(图6)。与TAC17转化相比 较,TAC27转化水稻时,筛选阶段抗性愈伤组织与 非抗性愈伤组织区分明显,且抗性愈伤组织在筛选 阶段就会表现出明显的抗性和增殖。而以TAC17转 化水稻时,经过两次、近一个月的筛选,抗性愈伤组织 与非抗性愈伤组织区分不明显,往往到预分化甚至分 化阶段才能区分开来。将抗性愈伤组织接入预分化 培养基中光照培养15 d左右,然后接入分化培养基 中进行分化成苗,有大量的再生苗出现(图7)。 图6 TAC27转化水稻的抗性愈伤组织筛选 图7 TAC27转化水稻抗性愈伤组织植株分化 2.2.2转化植株PCR检测 以TAC27载体T— DNA区右侧植物标记基因 £基因部分序列为扩增 引物进行PCR扩增。结果表明,以 £基因部分序 列扩增引物进行扩增时,转化植株均能扩增出与质 粒扩增带相同、大小为560 bp的带型(图8)。 3讨论 TAC载体系统已被广泛应用到植物基因工程 中,利用TAC载体系统已经构建了拟南芥、大豆、百 1.空白对照(水);2.阴性对照(未转化7001S植株);3.阳性 对照(TAC17质粒); .转化苗;M.分子量标记。 图8 7001S转化苗npt基因PCR扩增结果 脉草、金鱼草、小麦、大麦、水稻等植物的基因组文 库。本研究所采用的基因组文库是小群体的混合基 因组文库,在进行文库筛选时经过两次筛选获得了 阳性克隆。同时,在点膜时采用对角线重复印膜,从 而可以避免假阳性结果的出现。本研究所利用的探 针能够筛选基因组文库成功获得阳性克隆,同时也 证明了所采用的基因组文库覆盖率大。 TAC载体系统已经经过多次改造,目前已有 TAC7、TAC17、TAC27、TAC537等,以适应不同植物 材料和目的使用。TAC17和TAC27均以水稻肌动 蛋白ActI为启动子,适合于单子叶植物的遗传转 化,它们的区别在于TAC17以bar基因为筛选标记 基因,而TAC27以hpt为筛选标记基因。研究表明 TAC17转化水稻是稳定、可靠的 ,但在筛选过程 中,不同基因型材料筛选剂浓度差异较大,且存在筛 选时间长以及转化体和非转化体难以区分等不足。 本研究采用TAC27转化水稻,结果表明TAC27的结 构在农杆菌和大肠杆菌中均是稳定的,以TAC27转 化水稻筛选效果好,筛选时间短,转化是成功的。从 而为水稻基因克隆和基因功能分析打下了基础。 参考文献: [1]uuYG,ShiranoY,FukakiH,et a1.Complementation of plantmll- tams with large genomic DNA fragments by a transformation—・compe- tent artiifcial chromosome vector accelerate positional cloning[J]. Proe Nail Acad Sci USA,1999,96:6535—6540. [2]Liu Y g,Nagaki K,Fujita M,el a1.Development of粕efifcient maintenance and screening system for large—-insert genomic DNA li- braries of hexaploid wheat in a transformation—competent artiifcila chromosome(TAC)vector[J].The Plnat ̄umal,2000,23(5):687 —695. [3]“uYG,LiuHM,QiuwH,et a1.Developmentofnewtransforma. tion—Competent artiifcial chromosome vectors and rice genomic li. braries for eifcient gene cloning[J].Gene,2002,282:247—255. (下转第2l页) 维普资讯 http://www.cqvip.com 李群等:麦田留高茬免耕抛秧稻生产技术 ~21— 2.5动态施肥 d后湿润、薄水抛秧。 2.5.1 施氮调节碳氮比 除按照常规抛秧高产肥 料运筹外,麦田秸秆直接全量还田第一年,因为麦草 3.4适龄、薄水抛秧促早发 为碳氮比值高的秸秆而水稻为耗氮量大的作物,需 秧苗叶龄3.5~4.O叶,施用壮秧营养剂育秧的 要根据秸秆还田量,增施氮肥调节碳氮比,否则将造 叶龄可延迟至4.0~4.5叶,施好送嫁肥,适期薄水 成减产;第二年可以增施氮肥调节碳氮比,促进作物 抛秧。大田抛秧65~70 ̄/667m ,折合2.6万~2.8 的增产幅度;随着大量秸秆还田,营养元素释放,第 万穴/667m (3苗/穴左右),基本苗7万~ 三年调节碳氮比与否,对作物产量无显著性影响。 8万/667m 。先迎风高抛,然后下田近距离补抛,抛 2.5.2磷钾肥施用 根据田间肥力现状及变异趋 足、抛匀所需基本苗。 势,钾肥主要在分蘖盛期施用,后期主要依靠秸秆腐 3.5大田水浆管理 解提供钾肥;磷肥以基肥为主,根据水稻产量目标, 抛后保持3~5 ca3水层活棵;活棵后浅水促蘖, 适量增减。 并适时落于排酸增氧,避免还原性物质过多积累危 3技术流程 害根系发育;达到预定苗数70%~80%时,适度搁 田,控苗促根;中后期湿润管理为主,以水调肥,促根 3.1 麦田沟系配套,适量播种 壮秆,浅水灌浆,活熟到老。 控制好麦子基本苗,田面畦宽2.5~3.0 m,沟 3.6大田肥料运筹 宽20 cm,深2O~25 cm,根据田间草相,适时化除。 施肥坚持采用“两头促,中间控”的原则,施纯 3.2培育适龄壮秧 氮18~20 kg/667m 。麦收后施碳酸氢铵25~30 麦收前15~20 d,进行晒种一药剂浸种一催芽 kg/667m 上水沤制;抛秧5~6 d活棵立苗后,施BB 一播种;按1:35(秧田与大田面积比)备足苗床,塑 肥2O~25 kg/667m +尿素5~7.5 kg/667m ,或尿 盘育秧、二段浇浆,大田用种3~3.5 kg/667m ,播净 素1O~12.5 kg/667m +氯化钾7.5~10 kg/667m 种5O g/盘(434孔),成秧1 100苗/盘左右。秧田 +过磷酸钙25~30 kg/667m ;施好平衡肥:抛秧后 施用塑盘育秧专用肥35 kg/667m ,水浆管理以湿润 15~20 d,施尿素5~7.5 kg/667m ,叶色深的田块 为主,3叶期后旱管,忌水层管理;采用无盘窗纱旱 可不施,叶色淡的则重施;穗肥:在叶龄余数2.5~3 育技术,使用旱育保姆专用肥,培育壮秧,及时用药 时,施尿素1O・15 kg/667m +氯化钾10 kg/667m 。 控制病虫草危害,移抛时浇透水,增加水稻秧苗根部 3.7病虫草综合防治 泥球。 在做好常规病虫草害综合防治的同时,特别注 3.3 高茬收麦,余草入墒,氮肥沤制 重灰飞虱防治,严控条纹叶枯病发生危害;中后期注 麦收时留高茬2O~30 cm收割,余草斜插入墒 意防治纹枯病、稻曲病及螟虫、褐飞虱等病虫的危 沟,全量还田。灌水6~8 cm,施碳酸氢铵25—30 害,确保丰产丰收。 kg/667m ,调节碳氮比,加速麦草矿化腐解(如麦田 3.8 杂稻处理 杂草量大,上水前用灭生性除草剂清洁田面),5~7 分蘖拔节期发现杂稻立即拔除。 (上接第1O页) [6]郭熙志,刘耀光,罗达.以可转化人工染色体TAC载体为基础 [4]Sawa S,Watanabe K,Goto K,et a1.FILAMENTOUS FLOWER,a 的百脉根基因组文库的构建及筛选[J】.植物生理与分子生物 meristem and organ identity gene of Arabidopsis,encodes a protein 学报,2004,30(2):234—238. with a zinc finger nad HMG—related domain[J].Genes Develop— [7]H L,Qu R,Kochko A,et a1.An improved lfee transformation system ment,1999,13:1079—1088. uging the biolistic method[J].Plant Cell Reports,1993,12:250~ 【5]Sato S,Kato T,Kakegawa K,et a1.Role of putative membrane— 255. bound endo一1,4一B—glucana ̄KORRIGAN in cell elongation and 【8]周玲艳,姜大刚,吴豪,等.基于TAC载体的水稻转化系统的 cellulose synthesis in Arabidopsis thaliana[J].Plnat Cell Physiol, 建立[J].遗传学报,2005,32(5):514—518. 2001,42:251—263.