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一种DNA结合蛋白接口几何结构特征的分析方法[发明专利]

来源:爱go旅游网
专利内容由知识产权出版社提供

专利名称:一种DNA结合蛋白接口几何结构特征的分析方法专利类型:发明专利发明人:王伟,李克亮

申请号:CN201710471068.1申请日:20170620公开号:CN109101784A公开日:20181228

摘要:本发明涉及一种DNA结合蛋白接口几何结构特征的分析方法,属于生物计算技术领域。本发明首先从蛋白‑DNA复合数据集中提取蛋白‑DNA结合位点信息;然后根据蛋白‑DNA结合位点信息确定蛋白‑DNA结合位点的残基形态指数特征和空间环境特征;最后将所确定的蛋白‑DNA结合位点的残基形态指数特征和空间环境特征作为特征向量,利用分类模型对获取的特征向量进行分类。本发明通过从残基形态结构和空间环境特征角度分析了双链DNA结合蛋白(简称:DSBs)和单链DNA结合蛋白(简称:SSBs)的结合特异性,有助于深入理解蛋白‑DNA的结合机制,而且本发明也能够应用于蛋白‑RNA、蛋白‑蛋白等领域研究。

申请人:河南师范大学

地址:453007 河南省新乡市建设东路46号

国籍:CN

代理机构:郑州睿信知识产权代理有限公司

代理人:吴敏

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