法律分析：职务犯罪是指公职人员滥用职权、玩忽职守、受贿、贪污等违法犯罪行为。当事人在受到职务犯罪的侵害时，应积极维护自身的合法权益。具体措施包括：
1.及时报案，保留相关证据，协助调查机关依法查处犯罪行为。
2.通过律师等法律途径，维护自身的合法权益，包括要求赔偿经济损失、精神损害等。
3.通过司法救济，利用法律程序保护自身的合法权益，包括起诉、申请赔偿等。
法律依据：
《刑法》第三十一条 公务员滥用职权，玩忽职守，徇私舞弊，给国家利益或者人民群众利益造成损失的，依法追究刑事责任。
《刑事诉讼法》第一百一十七条 公诉机关不起诉或者撤诉后，被害人、当事人可以在六个月内向人民法院申请追诉或者再审。
《民事诉讼法》第一百一十四条 当事人之间发生争议，一方申请人民法院进行诉讼时，应当向被申请人提出和解或者调解的请求。
以上是职务犯罪案件中如何保护当事人的合法权益的法律分析和法律依据。当事人应当积极采取措施，依法维护自身的合法权益。
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