集体户口的弊端有：1、如员工需要户口的相关证明，或辞职，会给人力资源增加很多的手续。如结婚、生育、出具户籍证明、办理身份证换代等；2、集体户口制度，催生了代办户口的行业，行业内充满诈骗，受贿，权钱交易。尤其在北京，上海等大中城市；3、农转非后办的集体户口，不能回原籍，落户需要买房；4、如夫妻双方均为集体户口，结婚、计生和小孩户口问题办理不了；5、婚后的集体户口不能迁移回原籍；6、集体户口二手房公积金贷款需要担保人；7、如果以后不在公司工作了，离职的时候不需要转出也能离职成功；8、集体户口是暂时还不具备单独立户条件，或者暂时还没有办理单独立户手续的居民的户籍关系挂靠在某一个集体户头上的居民户口。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国户口登记条例》第三条第三款居住在机关、团体、学校、企业、事业等单位内部和公共宿舍的户口，由各单位指定专人，协助户口登记机关办理户口登记；分散居住的户口，由户口登记机关直接办理户口登记。
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