一般住院期间检查胃镜是可以通过医保报销的，门诊检查一般无法进行报销。
一般而言，在我国参与城镇职工医疗保险，门诊胃镜检查大多可以按比例报销。新农村合作医疗保险的公民，门诊胃镜检查一般不能报销，住院时检查胃镜的费用可以报销，但并不一定是全部报销，大多数也是按比例报销。同时，医保会设置起付线及限额，低于起付线或超出限额部分都不予报销。
医保报销范围包括：
1、抢救期间医疗费用。
2、住院期间医疗费。
3、手术材料及辅助用具。
4、床位费：按当地医保标准。若因急性-脑外伤、复合性内脏损伤昏迷需住ICU（重症监护病房）者除外，但脱离危险后应立即转入普通病房。
5、康复理疗费：按当地医保标准。原则上不得超过3种，医保范围以外的康复理疗不予赔偿。
6、换药及康复功能指导训练：按当地医保标准结合病情需要核定。
7、救护车费：按当地卫生部门及物价部门核定的标准计算。
8、其他费用：按照规定的不予赔偿的费用不予赔偿。
9、续医费：被保险人为提前结案，对伤者未来可确定且必须的续医费用可提前支付。
综上所述：胃镜的费用医保是完全进行报销的，是属于医保报销的范围，但具体报销的费用还是要根据你具体医保的情况才能够完全明确，农村医保报销的费用相对会低一些。
【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》
第二十七条
参加职工基本医疗保险的个人，达到法定退休年龄时累计缴费达到国家规定年限的，退休后不再缴纳基本医疗保险费，按照国家规定享受基本医疗保险待遇；未达到国家规定年限的，可以缴费至国家规定年限。
第二十八条
符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服努设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。