保护关联交易中少数股东利益的方式：
1、积极完善股东的知情权，例如，建立完善的信息披露制度、股东质询制度；
2、赋予少数股东在特定情形下，直接起诉的权利；
3、其他方式。
关联交易违法吗
首先，关联交易可能会增加公司的经营风险，使公司陷入财务困境，有可能产生坏账的风险：如大股东提供担保、资金或大股东以其他方式占用公司的资金均会给公司带来潜在的财务风险；如果和大股东及关联人员进行不等价交易会降低公司的利润。其次，影响公司独立经营能力，抗外部风险能力下降 。过多的关联交易会降低公司的竞争能力和独立性，使公司过分依赖关联方，尤其是大股东。例如，有的公司原材料采购和产品销售的主要对象都是关联方，其经营自主权受到很多限制。由于公司的独立性差，对关联方依赖较强，导致市场竞争力下降，若关联方自身难保，则公司就可能进入低谷了。最后，大量关联交易的发生会对公司的形象产生负面的影响，使潜在的客户减少。使潜在的客户不愿意与公司进行交易。公司的商誉将受到很大伤害，也不利于公司长远健康发展。公司的控股股东、实际控制人、董事、监事、高级管理人员不得利用其关联关系损害公司利益。违反前款规定，给公司造成损失的，应当承担赔偿责任。
《公司法》
第二十一条公司的控股股东、实际控制人、董事、监事、高级管理人员不得利用其关联关系损害公司利益。
违反前款规定，给公司造成损失的，应当承担赔偿责任。
法律依据：
《公司法》第二十二条 【公司决议的无效或被撤销】公司股东会或者股东大会、董事会的决议内容违反法律、行政法规的无效。
股东会或者股东大会、董事会的会议召集程序、表决方式违反法律、行政法规或者公司章程，或者决议内容违反公司章程的，股东可以自决议作出之日起六十日内，请求人民法院撤销。
股东依照前款规定提起诉讼的，人民法院可以应公司的请求，要求股东提供相应担保。
公司根据股东会或者股东大会、董事会决议已办理变更登记的，人民法院宣告该决议无效或者撤销该决议后，公司应当向公司登记机关申请撤销变更登记。 该内容由 杨振军律师 和 律说律答 共创回答