处理劳务派遣合同纠纷的方式：由派遣单位与用工单位等进行协商；协商不成的，找调解组织来进行调解；调解不成的，找有管辖权的劳动争议仲裁委员会来裁决；或者依法向法院起诉。
一、劳动纠纷找哪个部门办
发生劳动纠纷后可以找下列部门：向企业劳动争议调解委员会、基层人民调解组织或在乡镇、街道设立的具有劳动争议调解职能的组织申请调解；向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服，向管辖权的人民法院依法提起诉讼。
二、劳务派遣公司随意克扣员工工资怎么处理
劳务派遣公司随意克扣工资，劳动者可以通过以下方法维权：与劳务派遣公司协商；向基层人民调解组织、企业劳动争议调解委员会或在乡镇、街道设立的具有劳动争议调解职能的组织申请调解；调解不成，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服，向人民法院提起诉讼。
三、发生劳动争议应该怎么办
发生劳动争议，用人单位与劳动者可以协商；协商不成，可以向调解组织申请调解；调解不成，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。解决劳动争议，应当根据事实，遵循合法、公正、及时、着重调解的原则，依法保护当事人的合法权益。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第四条
发生劳动争议，劳动者可以与用人单位协商，也可以请工会或者第三方共同与用人单位协商，达成和解协议。
第五条
发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。
第六条
发生劳动争议，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；用人单位不提供的，应当承担不利后果。