（一）两罪存在的时间截点不同
掩饰、隐瞒犯罪所得罪针对的是犯罪所得及其产生的收益，因此必然发生于上游犯罪既遂之后；而帮助信息网络犯罪活动罪是为犯罪提供技术支持，或者提供广告推广、支付结算等帮助的行为，因此并不能区分是发生在上游犯罪过程中还是既遂之后，从实践来看，通常发生在上游犯罪实施过程中，也存在于上游犯罪既遂之后。
（二）两罪对主观明知的程度要求不同
帮助信息网络活动罪和掩饰、隐瞒犯罪所得罪都要求“明知”，但是两罪对“明知”要求的程度并不相同。帮助信息网络活动罪对上游犯罪通常限定于一种概括性的明知，即知晓上游行为极可能系犯罪行为或某种犯罪行为，并不知道上游犯罪的具体实施和行为。若明确知道上游犯罪实施何种具体犯罪行为，仍然为其提供帮助支付结算的，则通常以上游犯罪的帮助犯定罪处罚。而掩饰、隐瞒犯罪所得罪对上游犯罪的“明知”程度并没有要求，因为上游犯罪已经既遂，只要不存在事前的共谋，无论明知程度如何，都不会评价为上游犯罪的帮助犯。因此，对于上游犯罪的“明知”，既可以是概括性的明知，也可以是明确知道。
（三）两罪的行为对象及客体不同
帮信罪的行为对象是，正在实施中的信息网络犯罪行为；而掩饰、隐瞒犯罪所得罪的行为对象是，犯罪所得及其产生的收益，也就是赃款赃物。
帮信罪规定在《刑法》扰乱公共秩序罪的章节中，侵犯的客体为公共秩序，增设本罪是为了更准确、有效地打击各种网络犯罪帮助行为，保护公民人身权利、财产权利和社会公共利益，维护信息网络秩序，保障信息网络健康发展；掩饰、隐瞒犯罪所得罪规定在《刑法》妨害司法罪的章节中，侵犯的客体是司法机关的正常活动，本罪行为使赃款、赃物被转移，妨害司法机关利用赃款、赃物证明犯罪人的犯罪事实，妨害对赃款、赃物的查获、追缴、返还，妨害刑事侦查、起诉、审判等司法活动。