对于无效的建设工程施工合同的处理办法是，如果建设工程经验收合格的，可参照合同中工程价款的约定折价补偿给承包人；如果验收不合格，能修复的，在扣除修复费用后向承包人付款；不能修复的，发包人可以不支付工程款。
【法律依据】
《民法典》第七百九十三条
建设工程施工合同无效，但是建设工程经验收合格的，可以参照合同关于工程价款的约定折价补偿承包人。
建设工程施工合同无效，且建设工程经验收不合格的，按照以下情形处理：
（一）修复后的建设工程经验收合格的，发包人可以请求承包人承担修复费用；
（二）修复后的建设工程经验收不合格的，承包人无权请求参照合同关于工程价款的约定折价补偿。
发包人对因建设工程不合格造成的损失有过错的，应当承担相应的责任。
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