与该机构协商退款，双方做出各自的让步减少诉讼带来的时间还金钱成本上的消耗。达不成协议的，可以向法院提起诉讼，表明该机构违约带来的损失，请求法院判决该机构退还定金并且可以要求其赔偿一些违约金。机构退款但是扣钱的行为并不合理，即便是没有了单据，但是该机构肯定也有你交款的证明，并不能因为丢失单据而扣钱。消费者可向消费者所在地的消费者协会投诉，也可向责任者所在地的消费者协会投诉。消费者协会在接到投诉后，将消费者投诉的问题转交到被投诉单位，并要求在规定的时间内作出问题的处理与答复。
法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》 第一百一十九条 起诉必须符合下列条件：
(一)原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织;
(二)有明确的被告;
(三)有具体的诉讼请求和事实、理由;
(四)属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。