交了灵活就业不需要交新农合。个人办理社会保险应当按照自由职业者的情况办理；如果个人参加社会保险，就应当按照自由职业者参加社会保险的办法执行自由职业者，只能参加养老保险和医疗保险。养老保交了灵活就业社保一般不需要交农村医保的和医疗保险的缴纳。
申请社会保险补贴的灵活就业人员，本人要持证明灵活就业状态相关凭证到户籍所在地街道（乡镇）劳动保障服务中心进行灵活就业认定，填写《灵活就业情况登记表》，经街道（乡镇）劳动保障服务中心认定后予以就业登记，并在《就失业证》中记录从事灵活就业有关情况。凡具有本市城镇户籍、符合参保条件需参加社会保险的灵活就业人员。
【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》第十条
职工应当参加基本养老保险，由用人单位和职工共同缴纳基本养老保险费。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加基本养老保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加基本养老保险，由个人缴纳基本养老保险费。
公务员和参照公务员法管理的工作人员养老保险的办法由国务院规定。