企业转型升级是企业发展过程中必经的阶段，但在这个过程中，企业所面临的税务问题也会相应增多。针对这个问题，我们可以从以下几个方面来进行处理：
一、合理规划企业转型升级方案
企业转型升级方案的制定需要考虑到税务因素，以避免在转型升级后出现不必要的税务风险。企业可以寻求税务专家的意见，对转型升级方案进行评估，确保方案的合法性和可行性。
二、及时了解税收政策
企业应及时了解税收政策的变化，切实掌握税收政策的相关内容和要求，以便在企业转型升级过程中及时调整经营策略，减轻税务负担。
三、合理利用税收优惠政策
企业可以根据自身情况，合理利用税收优惠政策，降低税费负担，增加企业的经营收益。但在利用税收优惠政策时，企业应注意遵守相关规定，避免违法行为。
四、加强内部税务管理
企业应加强内部税务管理，建立健全的税务管理制度，规范企业的税务操作流程，确保税务申报的准确性和及时性，避免因税务问题导致企业经营风险。
综上所述，企业在转型升级过程中，需要重视税务问题，合理规划转型升级方案，及时了解税收政策，合理利用税收优惠政策，加强内部税务管理，以确保企业转型升级的顺利进行。