1、牛奶盒材质问题：正常情况下微波炉是可以热牛奶的，但不可直接将牛奶盒放入微波炉中加热，因为牛奶盒里层为锡箔，属于金属成分，透过微波加热较慢，还易引发火花，因此一般加热牛奶需要倒入可微波炉加热的容器里再进行加热才行。
2、加热过度的问题：微波炉的加热时间要视材料及用量而定，像牛奶以水分为主，加热速度快，一般不超过1分钟为宜，要是过度加热不仅会降低牛奶的口感，还会流失部分营养，降低食用价值。
3、牛奶瓶的问题：部分玻璃装的牛奶瓶并不适合加热，因为不耐高温，而且瓶颈窄小，容易因加热过度而压力膨胀，引致爆炸现象。